آنالیز داده های NGS

سلام دوست عزیز. Alignment یکسری چالش هایی دارد، از جمله اینکه یکسری تفاوت هایی در ژنوم هر فرد وجود دارد که کار را سخت می کند، چون 100 درصد که یکسان نیستند. Alignment مناطق تکراری مشکل ساز هستند.کیفیت خوانش ها پایین باشد، alignment مشکل ساز می شود.