بازده واکنش PCR

عوامل زیادی روی بازده PCR تاثیرگذار هستند مثل مواد مهارکننده واکنش(هموگلوبین ،اوره، هپارین،ترکیبات فنولی و ارگانیگ ،چربی و کلسیم) تخریب الگو ایجاد محصول PCR غیر اختصاصی در واکنش و حتی غلظت زیاد الگو همه و همه روی بازده واکنش شما تاثیر منفی خواهند داشت که برای بهبود آن میتوانید از تقویت کننده های PCR مثل DMSO ،گلیسرول ،BSA و یا فرمامید در واکنش هاتون استفاده کنید. همچنین تولید محصولات PCR غنی از GC دشوار است. برای بهبود تکثیر ، دمای Annealing را افزایش دهید. برای دقت بیشتر ، می توانید دمای Annealing را با استفاده از یک گرادیان حرارتی بهینه کنید.

بازده PCR را می توان به عنوان نسبت تعداد مولکولهای ژن هدف در پایان یک سیکل PCR بر تعداد مولکولهای هدف در شروع سیکل PCR تعریف کرد. کارایی را می توان به صورت نسبت یا درصد نشان داد. حداکثر ، یک توالی هدف در هر سیکل می تواند دو برابر شود ، زیرا DNA فقط دو رشته دارد. این کارایی را می توان 2 یا 100٪ در نظر گرفت.