انواع هم ردیفی

همردیفی کلی یا Global و همردیفی موضعی یا Local. همردیفی کلی یا Global تشابه کلی بین توالی ها را مد نظر قرار می دهد و در نتیجه براساس کل طول توالی ها انجام خواهد شد. در حقیقت در همردیفی کلی، همردیفی از ابتدای توالی ها شروع شده و به صورت نقطه به نقطه تا انتها ادامه می یابد. در بسیاری از حالات ممکن است دو توالی با همدیگر تشابه کلی نداشته باشند، ولی ممکن است برخی از آنها تشابه زیادی با همدیگر داشته باشند که از راه همردیفی موضعی می توان این نواحی را مشخص کرده و براساس آن درباره ی رابطه بین دو توالی قضاوت کرد