مزایا و معایب روش TOPO کلونینگ

مهمترین عیب کلونینگ TOPO این است که تعداد کمی از وکتورهای پلاسمیدی TOPO وجود دارد و ایجاد یک وکتور TOPO توسط خود شما عملی نیست. علاوه بر این، بازده می‌تواند بسته به پلیمراز مورد استفاده متفاوت باشد، و بازهای منفرد A با گذشت زمان تخریب شوند، و همچنین کارایی اتصال را کاهش دهد. پلاسمیدهای آماده Gateway Entry TOPO نیز در دسترس هستند که امکان کلونینگ سریع محصولات PCR در پلاسمیدهای اهدا کننده را بدون نیاز به کلونینگ آنزیم محدودکننده فراهم می‌کنند.