مفهوم کلونینگ

از لحاظ مفهوم کلی هر دو تقریبا برای زیاد کردن و تکثیر به کار می‌روند، اما یکی از بزرگترین تفاوت‌های آنها این است که PCR در محیط Invitro انجام می‌شود و کلونینگ در محیط Invivo انجام می‌پذیرد.

از دیگر تفاوت‌های این دو می‌توان به زمان واکنش‌ها اشاره کرد که کلونینگ معمولا چند روز طول می‌کشد اما PCR طی چندساعت پایان می‌یابد.