علت تکرار دمای اول و آخر pcr

قبل از سیکل های PCR  که در Stage 2 قرار دارد باید Stage 1‌ را اعمال کنیم که یک دناتوراسیون اولیه است. در این مرحله، دمایی معادل 95 درجه به کل محتوای ژنومی اعمال می شود تا جدا سازی دو رشته ژنومی از هم در سیکل 1 PCR راحت تر و دقیق تر انجام شود.

پس از اتمام واکنش، چون ممکن است تمام زنجیره ها فرصت کافی برای تشکیل شدن را نداشته باشند، مجددا به مدت 5 دقیقه دمای 72 درجه که اپتیمم دمای طویل سازی است را اعمال می کنیم تا زنجیره های ناتمام به طور کامل تشکیل شوند.