علت حظم آنزیمی در PCR-RFLP

چون در این تکنیک از آنزیم محدود کننده استفاده می کنید، این آنزیم می تواند بر روی کل مختوای ژنومی جایگاه های برش متعددی داشته باشد. به همین دلیل باید ابتدا PCR انجام دهید تا فقط قطعه مورد نظر شما باقی بماند و آنزیم تنها بر روی قطعه اختصاصی شما اثر کند.

چون توالی مورد نظری را که می خواهید هضم آنزیمی انجام دهید ممکن است در نواحی مختلفی از ژن شما تکرار شود بنابراین برای جلوگیری از اصراف آنزیم و افزایش دقت کار باید قطعه مورد نظر خود را به کمک PCR جدا کرده و روی آن هضم آنزیمی را انجام دهید.