منظور از Exon trapping

سلام دوست عزیز. یکی از روش های یافتن اگزون ها در یک توالی ژنومی، به دام اندازی اگزون یا Exon trapping می باشد. در این روش از نوع خاصی ناقل که حاوی یک mini gene است، استفاده می شود. Mini gene از دو اگزون در دو طرف و یک اینترون در وسط تشکیل شده است. قبل از اگزون اول نیز توالی مورد نیاز جهت شروع نسخه برداری در سلول های یوکاریوتی وجود دارد. برای استفاده از ناقل فوق، قطعه ی DNA ی مورد مطالعه پس از برش با آنزیم محدود شده وارد محل محدود شده موجود در اینترون ناقل می گردد. پس از انتقال ناقل به داخل رده سلولی مناسب، نسخه برداری انجام می شود و RNA ی حاصل پس از پیرایش حاوی تمام اگزون های موجود در قطعه مورد مطالعه، بین اگزون های بالادست و پایین دست mini gene است. در این مرحله با کمک پرایمرهایی که به اگزون های mini gene متصل می شوند، RT-PCR انجام و DNA ی حاصله توالی یابی می شود. از آنجا که توالی mini gene از قبل مشخص است، به این ترتیب می توان جایگاه نوکلئوتیدهای شروع و پایان اگزون را دقیقا تعیین نمود.